Geç Neolitik Erken Kalkolitik Çağ'dan itibaren Tunç Çağı, Hitit, Urartu, Frig, İskit-Kimmer, Pers, Pontus, Roma, Bizans, Selçuklu ve Osmanlı Dönemlerine ait birçok medeniyetin eserlerini bir arada görmek mümkündür.
        İlhanlıların Anadolu hakimiyeti döneminde Amasya'da nazırlık ve emirlik yapmış kişilere ve yakınlarına ait mumyaların bulunduğu bölüm, müzenin en ilgi çeken yeridir. Ayrıca Amasya Müzesi koleksiyonu içerisinde yer alan Roma Dönemine ait Elmalı Mozaik, kendi eser grubu içerisindeki nadir örneklerdendir. Bu mozaiğin üzerinde yer alan elma ağacı, meşhur misket elmasıyla özdeşleşmiş Amasya'da 1700 yıl öncesinde de elmanın önemli bir meyve olduğunu bizlere göstermektedir.

(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)


(Fotoğraf: Amasya İl Kültür ve Turizm Müdürlüğü Arşivi)